Amber
Description Amber est une suite de programmes de simulation biomoléculaire.Le terme « Amber » fait référence à deux choses. Premièrement, il s’agit d’un ensemble de champs de force de mécanique moléculaire pour… Read more »
Author Archives: Jean-Baptiste Hoock
Autoconf
Description Autoconf est un outil qui génère automatiquement des scripts de configuration portables pour les logiciels. Il analyse l’environnement du système (compilateur, bibliothèques, options disponibles, etc.) afin de créer un… Read more »
Automake
Description Automake est un outil qui génère automatiquement des fichiers Makefile portables pour les logiciels. Il utilise des modèles de Makefile (appelés Makefile.am) et crée des Makefile standards conformes aux… Read more »
COMSOL Multiphysics
Description COMSOL Multiphysics est un logiciel de simulation numérique basé sur la méthode des éléments finis (FEM), utilisé pour modéliser et analyser des phénomènes physiques multidisciplinaires. Il permet de simuler… Read more »
CUDA
Description CUDA (Compute Unified Device Architecture) est la plateforme de calcul parallèle développée par NVIDIA. Elle permet d’exécuter du code sur GPU via une extension du C/C++ et un ensemble… Read more »
DSI Studio
Description DSI Studio est un logiciel de tractographie pour l’IRM de diffusion, le suivi des fibres et le connectome. Il cartographie les connexions cérébrales et met en relation les résultats… Read more »
FreeSurfer
Description FreeSurfer est un logiciel d’analyse neuroanatomique pour l’IRM structurelle, la segmentation cérébrale et la reconstruction de la surface corticale. Il extrait automatiquement l’épaisseur corticale, le volume des structures sous‑corticales… Read more »
Gromacs
Dernière version installée : 2025.2 Description GROMACS, qui signifie « GROningen MAchine for Chemical Simulations », est un logiciel de simulation moléculaire largement utilisé dans le domaine de la chimie computationnelle, de… Read more »
HDF5
Description HDF5 (Hierarchical Data Format version 5) est un format de fichier et une bibliothèque logicielle conçus pour stocker et organiser de grandes quantités de données complexes. Mise en place… Read more »
help2man
Description help2man est un outil en ligne de commande qui génère automatiquement des pages de manuel simples (pages man) à partir des sorties –help et –version d’un programme. Il est… Read more »